Mercedes вместе с AMG построил CLK GTR для борьбы в новом чемпионате FIA GT. Это был гоночный GT1, лишь отдалённо похожий на дорожный CLK. Удивительно, но его разработали всего за 128 дней. Ускорить работу помогло то, что купили McLaren F1 GTR и использовали его как тестовое шасси, пока AMG ставила собственный кузов и 6,0-литровый V12 на базе M120.
Он сразу стал доминировать. В дебютном сезоне 1997 года выиграл чемпионат FIA GT, взяв оба титула вместе с Берндом Шнайдером, и повторил это в 1998 году. Для омологации AMG и HWA построили не менее 25 дорожных машин «Straßenversion» с увеличенным 6,9-литровым V12 мощностью свыше 600 л.с.
Книга рекордов Гиннесса зафиксировала дорожный CLK GTR как самый дорогой серийный автомобиль в мире на тот момент.