Zonda это автомобиль, с которого началась Pagani Automobili. Показанный на Женевском автосалоне 1999 года как C12, он сочетал внимание Орасио Пагани к открытому углеволокну и деталям ручной отделки с атмосферным V12 Mercedes-AMG. На самых первых машинах стоял 6,0-литровый двигатель; таких было построено лишь несколько, затем Pagani перешла ко всё более объёмным и мощным версиям. В 2002 году Zonda S получил 7,3-литровый V12 AMG, и этот объём использовался в самых известных вариантах модели.
За восемнадцать лет производства Zonda выпускалась во многих версиях: S, F, Roadster, Cinque, Tricolore, серия 760 и множество индивидуальных единичных экземпляров. Всего было построено примерно 140 машин, включая опытные образцы. Zonda задала дизайнерский язык Pagani и показала, что небольшая мастерская в Модене способна конкурировать с Ferrari и Lamborghini.